男性淋病急性期如未及时治疗或治疗不彻底，导致病情反复，病变可向上蔓延引起下列合并症。
淋菌性前列腺炎。是后尿道炎的常见合发症，病人有发热、尿痛、尿急、尿频、尿潴留，会阴、肛门有压迫感，疼痛较重时向腹部放射，排尿前或排尿后加重，可发生阳痿、早泄等性功能障碍。前列腺肛诊检查有明显压痛和触痛，前列腺肿大，严重时中间沟消失，前列腺分泌物中有大量脓细胞，直接镜检和培养可查到淋球菌。
淋菌性附睾炎、睾丸炎。淋球菌感染是男性附睾炎比较常见的原因，一般发生于淋病3-4周时，淋菌性前列腺炎之后，个别可更早。常由骑车、性交、饮酒、疲劳等因素诱发。
淋菌性附睾炎一般为单侧发病，有1/3病人呈急性发作，其余者发病缓慢，表现病侧阴囊红肿疼痛，疼痛可向同侧下腹部、腹股沟及髋部放散。附睾可在短时间内迅速肿大，超出正常许多倍，早期与睾丸境界清楚，后期融合成一片，形成附睾睾丸炎。如果精索水肿可压迫输尿管，导致两胁部疼痛。另外，其附睾炎常与其他合并症如前列腺炎、精囊炎等同时出现。
淋菌性附睾炎如能及时有效治疗，预后良好，但易复发。双侧附睾同时受累时，容易引起精液缺乏和不育。
精囊炎。是淋球菌感染经尿道和前列腺蔓延所致，常与前两种并发症同时存在。急性淋菌性精囊炎主要症状有下腹部疼痛，慢性者可出现血精。
尿道狭窄。长期不愈的尿道感染，可使局部形成瘢痕，引起尿道狭窄，一般发生于慢性尿道炎五到八年之后，表现为尿线细小、中断、排尿困难，严重时尿潴留。如狭窄波及输精管，可出现射精障碍、疼痛，也可继发不育。
女性感染淋病双球菌后，由于子宫颈发炎后不痛，女性尿道短而排尿较畅通，故经常发生漏诊和延误治疗。女性淋病多表现为子宫炎、前庭大腺炎、尿道旁腺炎和肛门炎，一般将直接感染或经局部蔓延扩散感染的女性淋病称之为无并发性淋病。通过宫颈上行感染导致子宫内膜炎、输卵管炎者称为有并发症性淋病。50%-70%女性淋病常无自觉症状。其并发症有：
前庭大腺炎。女性淋病中约有20%-25%的患者出现，其症状为前庭大腺红肿、疼痛，前庭大腺开口与阴道两旁，易受阴道和尿道排出脓液污染而发炎，严重时还可形成前庭大腺脓肿。
淋菌性盆腔炎。淋菌性盆腔炎常与急性淋菌性输卵管炎、子宫内膜炎同时存在，继发性输卵管、卵巢脓肿破裂后可引起盆腔脓肿、腹膜炎等。主要发生在年轻、生育年龄的妇女，多数病人月经后发作，如月经前发作可有经期延长，经血增多。全身症状明显，急性发烧，体温达38摄氏度以上，寒战、头痛、食欲不振、恶心、呕吐等，双下腹压痛，以一侧为重。
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