随着对动脉粥样硬化发生发展研究的深入，越来越多的证据表明其可能是一种慢性炎症性疾病。
各种炎性因子和巨噬细胞参与了斑块的形成。不稳定斑块的内部有M1型巨噬细胞大量浸润，分泌组织金属蛋白酶、单核细胞趋化因子，吸引T淋巴细胞以及嗜酸性粒细胞在斑块内聚集，易导致斑块剥脱或破裂。
干细胞可以使斑块内的M1型巨噬细胞转化为M2型，抑制炎性因子分泌，吞噬T淋巴细胞和嗜酸性粒细胞，促进斑块的稳定进而实现缩减。
干细胞通过分泌效应促进巨噬细胞的极化，使巨噬细胞M1（促炎型）向巨噬细胞M2（抗炎型）转化，进而消减炎症，发挥修复效应，这也是干细胞治疗多种疾病的中心环节。
此理论的提出为干细胞治疗多种疾病提供了理论基础，为干细胞的临床应用提供了新的方向。
目前国内的干细胞治疗需在具有细胞临床应用资质的细胞工程单位进行，一些三甲医院也有干细胞临床应用转化项目。
